Assistant-e ingénieur-e en biologie INSERM

Contrat d'apprentissage

3e année de Bachelor Universitaire de Technologie
Parcours biologie médicale et biotechnologie

Mission principale

L'apprenti-e aura pour mission de :

• - Participer au phénotypage de modèles murins mutants via le pipeline coulé comportement / imagerie vasculaire
• - Contribuer à l'analyse 3D des réseaux vasculaires cérébraux (transparisation, immunomarquage, acquisition en microscopie confocale et feuille de lumière, quantification)
• - Participer à l'analyse des modifications transcriptionnelles des cellules vasculaires (purification de vaisseaux, tri cellulaire, extraction d'ARN)
• - Contribuer au développement et à la standardisation des protocoles dans la perspective du plateau mutualisé IHU.

Activités principales

• Comportement et imagerie fonctionnelle : mise en œuvre des tests cognitifs chez des modèles murins, acquisition vidéo couplée à l'imagerie vasculaire, gestion des bases de données associées
• Histologie vasculaire 3D : préparation et transparisation des tissus cérébraux, immunomarquage des vaisseaux, acquisition en microscopie confocale et à feuille de lumière, analyse d'images 3D (densité et architecture des réseaux)
• Biologie moléculaire vasculaire : purification des vaisseaux cérébraux sur gradient,tri des cellules vasculaires sur colonnes Miltenyi, extraction d'ARN et préparation des échantillons pour analyse transcriptomique
• Analyse des données : traitement automatisé des données comportementales et d'imagerie à l'aide d'outils d'intelligence artificielle (machine learning, analyse non supervisée)

Vie de projet : contribution à l'optimisation et à la documentation des protocoles(bonnes pratiques, standardisation), participation aux réunions interdisciplinaires (biologiste, ingénieurs, data scientists)

Connaissances :

• Principes de la recherche animale (modèles murins)
• Techniques d'histologie (immunomarquage)
• Notions en microscopie (confocale idéalement)
• Bases en biologie moléculaire (extraction d'ARN, préparation d'échantillons)
• Notions en analyse de données et/ou statistiques
• Sensibilisation aux outils numériques et à l'analyse d'images
• Bases en biologie cellulaire et moléculaire
• Notions en biologie vasculaire

Savoir-faire :

• Réaliser des manipulations expérimentales en respectant des protocoles
• Mettre en œuvre des tests comportementaux chez l'animal
• Préparer des échantillons biologiques (tissus, cellules)
• Réaliser des techniques d'immunomarquage et de préparation tissulaire
• Participer à l'acquisition d'images (microscopie)
• Manipuler des outils informatiques pour le traitement de données
• Organiser, tracer et gérer des données expérimentales
• Appliquer les règles d'hygiène, sécurité et d'éthique (notamment animale)

Rédiger des comptes rendus expérimentaux

Aptitudes :

• Bon relationnel et communication
• Adaptabilité à des techniques variées
• Rigueur et précision expérimentale
• Capacité d'apprentissage et curiosité scientifique
• Esprit d'analyse et sens critique
• Autonomie progressive dans le travail
• Organisation et gestion du temps
• Capacité à travailler en équipe interdisciplinaire

Localisation : 33600 Pessac