Apprenti(e) en Biotechnologies (H/F) CNRS

Contexte scientifique :
Notre équipe se consacre à la lutte contre les mycobactéries pathogènes en étudiant leur métabolisme lipidique et leur lien avec la pathogénie. Nous identifions et validons le rôle physiologique des enzymes lipolytiques chez des mycobactéries comme Mycobacterium tuberculosis, M. abscessus, M. marinum et M. ulcerans, ainsi que leur régulation pendant l'infection et leur impact sur la phase de dormance. Ces enzymes sont essentielles à la croissance bactérienne, la virulence, la dormance et la biosynthèse de la paroi cellulaire. De plus, nous nous intéressons aussi à découvrir de nouvelles molécules antimycobactériennes (synthétiques ou peptidiques) ciblant la biosynthèse lipidique, et développons des tests diagnostiques associés.
Nous avons récemment identifié une nouvelle famille d'inhibiteurs d'enzymes lipolytiques, les CyC, présentant un fort potentiel antituberculeux et ouvrant de nouvelles perspectives thérapeutiques.
Dans ce cadre, nous recherchons un(e) apprenti(e) en Biotechnologies pour une durée d'1 an afin de participer à un projet innovant : l'évaluation de l'efficacité de nouvelles associations d'antibiotiques (CyC/macrolides) sur des souches cliniques de Mycobacterium abscessus, isolées de patients atteints de mucoviscidose.
Les missions qui vous seront confiées visent à :
• Réalisation des expériences : Évaluation de la sensibilité des souches cliniques aux antibiotiques (CyC et macrolides) seuls ou en combinaison, via des techniques de micro- dilution en microplaques et des tests à la résazurine (REMA).
• Mise au point des conditions optimales pour la détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI) et des indices de concentration inhibitrice fractionnaire (FICI).
• Analyse des résultats : Interprétation des données générées par un Tecan Spark 10M™ et analyse génomique des souches cliniques les plus résistantes.
• Test des combinaisons d'antibiotiques sur des macrophages de souris infectés par M. abscessus, en utilisant des techniques d'imagerie avancées (CELENA® S Digital Imaging System, microscope confocal Leica SP5).
• Gestion des cultures cellulaires : Préparation et infection des cellules eucaryotes, mesure de la viabilité bactérienne intracellulaire par fluorescence.

Localisation : 13009 Marseille 9e Arrondissement